La persona titular de la Secretaria General exerceix les funcions que li atribueix la Llei 13/1989, de 14 de desembre, d'organització, procediment i règim jurídic de l'Administració de la Generalitat de Catalunya, les altres que li assigni la resta de la normativa vigent i les encomanades per delegació del conseller o consellera del Departament. Així mateix, li correspon la coordinació de les funcions departamentals relatives al compliment de les garanties de seguretat i qualitat en l'àmbit dels centres, serveis i establiments sanitaris i dels productes farmacèutics, de l'ordenació farmacèutica i de l'avaluació mèdica de les incapacitats laborals, com també de les polítiques en matèria d'ordenació i desenvolupament professional.