La Secretaria d'Hisenda, amb rang orgànic de secretaria general, en els termes previstos a l'article 11.2 de la Llei 13/1989, de 14 de desembre, té les funcions de reforçar les estructures de la hisenda de la Generalitat, planificar i vetllar per la implantació d'aquestes estructures i fer efectiu el desplegament de l'Administració tributària catalana. En concret, té les funcions següents:
a) Representar el Departament en les matèries pròpies d'aquesta Secretaria.
b) Analitzar i dissenyar el sistema tributari de la Generalitat de Catalunya.
c) Impulsar i coordinar l'aplicació del model fiscal a través de l'Administració tributària de la Generalitat de Catalunya i fer-ne el seguiment.
d) Impulsar i coordinar la col·laboració entre els òrgans i les entitats que integren l'Administració tributària de la Generalitat i les entitats i els organismes locals amb competències tributàries.
e) Impulsar i coordinar la política fiscal corporativa de l'Administració de la Generalitat i del seu sector públic.
f) Promoure la recerca econòmica i jurídica en l'àmbit dels ingressos impositius, així com la seva divulgació.
g) Planificar, dissenyar i executar els plans de formació en matèria tributària de la Generalitat i el seu sector públic.
h) Supervisar la gestió i explotació del joc i apostes.
i) Supervisar i donar suport a la Junta de Tributs de Catalunya en l'organització i funcionament, respectant-ne l'autonomia i independència, tant de la Junta com dels seus membres en l'exercici de les seves funcions.