La gestió de l'organització i el funcionament administratiu de l'Agència. L'elaboració avantprojecte del pressupost d'ingressos i despeses anual, i seguiment de l'execució, modificacions pressupostàries i compte de liquidació del pressupost. La gestió i coordinació del règim econòmic, la comptabilització de la despesa pública i la gestió pressupostària de l'Agència. La gestió i execució de la documentació comptable pressupostària i extrapressupostària. La gestió per a la contractació de tot tipus de subministraments, obres, consultoria i assistència, de serveis i de treballs específics, arrendaments, etc.; la gestió de compres. L'execució de les tasques de gestió de temes relacionats amb el personal i l'elaboració de les nòmines i de les liquidacions de la Seguretat Social. La gestió del patrimoni i la gestió dels mitjans necessaris de caràcter general per al funcionament de l'Agència. La gestió dels pagaments, les liquidacions de les obligacions fiscals i el control de la tresoreria i l'habilitació.