Col·laborar en el disseny del sistema d'espais naturals protegits de Catalunya mitjançant el PEIN i la xarxa Natura 2000.
Tramitar les propostes de declaració d'espais naturals protegits, incloent-hi els espais naturals de protecció especial, la inclusió d'espais al PEIN i a la xarxa Natura 2000 i les figures de protecció d'altres normatives i convenis internacionals, i participar en les que promogui l'Administració de l'Estat.
Elaborar i tramitar els plans d'ordenació dels recursos naturals.
Proposar l'adopció de mesures cautelars i preventives durant la tramitació dels instruments de protecció i de planificació dels espais naturals.
Col·laborar en la redacció de plans i programes globals de connectivitat biològica i ecològica, i de protecció d'hàbitats i sistemes naturals, en la redacció de plans, programes, projectes i directrius de protecció del
patrimoni geològic.
Assessorar i informar, quan escaigui, quant a plans territorials i altres plans globals, normes, estratègies i programes territorials i sectorials que tinguin incidència sobre la biodiversitat i el patrimoni natural.
Qualsevol altra funció de naturalesa anàloga que se li encomani.