Són funcions del Consell Rector:
El Consell Rector és l'òrgan de Direcció de l'Institut Català de Recerca per a la Governança del Mar. Estarà format per la persona titular de la Direcció General de Pesca i Afers Marítims, la persona titular de la Subdirecció General de Pesca i Aqüicultura, la persona titular de la direcció de l'Institut de Ciències del Mar i la persona titular del Departament de Recursos Marins Renovables de l'Institut de Ciències del Mar. Si es considera escaient, es nomenaran dos vocals, un per cada entitat. Actua com a secretari/ària, amb veu i sense vot, un/a empleat/ada públic/a adscrit/a a la direcció general competent en matèria de pesca i afers marítims.