Planificar, coordinar, organitzar i gestionar les línies d'ajuts directes i dels ajuts a les explotacions en el marc de l'Organització Comuna de Mercats (OCM), i dins de la Política Agrària Comunitària, excepte les mesures relatives a la transformació de productes agraris amb finalitat de regulació del mercat i els ajuts al consum, i l'emmagatzematge privat.
Coordinar la relació entre el Departament, el Fons Espanyol de Garantia Agrària i l'Administració General de l'Estat en relació amb els ajuts especificats a la lletra a) de l'apartat 1 d'aquest article.
Planificar i dissenyar les actuacions d'inspecció i control en la gestió dels ajuts i de la condicionalitat, així com organitzar i supervisar-ne el pagament.
Coordinar i supervisar la gestió dels diferents sistemes d'informació, bases de dades o registres que estiguin adscrits a la Subdirecció General.
Elaborar propostes amb relació a la normativa reguladora en matèria dels ajuts especificats a la lletra a) de l'apartat 1 d'aquest article.
Supervisar la gestió sobre el Catàleg d'Explotacions Agràries Prioritàries.
Qualsevol altra funció de naturalesa anàloga que se li encomani.