Controlar l'estat de conservació de les espècies protegides i amenaçades de la flora i la fauna.
Elaborar, tractar i difondre la informació sobre la fauna i la flora.
Mantenir i actualitzar el sistema d'informació geogràfica (SIG) de les espècies amenaçades i protegides.
Proposar i tramitar la declaració i/o revisió de l'estatus de les espècies protegides i amenaçades, i gestionar els plans de recuperació i de conservació de les espècies amenaçades.
Gestionar i coordinar projectes de reintroducció d'espècies i les autoritzacions o acreditacions de captura científica, captura, recol·lecció, tinença, fotografia, filmació, activitats esportives, foragitament, registre de taxidèrmia, falconeria i a d'altres de naturalesa similar.
Coordinar la tramitació dels expedients de limitació d'activitats ramaderes i agrícoles en sectors crítics de nidificació de fauna protegida i danys produïts per la fauna protegida.
Gestionar els centres de recuperació i reproducció en captivitat d'espècies i les accions de conservació ex situ i coordinar els centres de recuperació o reproducció.
Qualsevol altra funció de naturalesa anàloga que se li encomani.